Analyse Botanischer Sammlungsdaten
Biodiversität der Pflanzen
2026-05-29
1 Überblick
Willkommen in der Übung “Analyse Botanischer Sammlungsdaten”. Auf dieser Webseite findet ihr Informationen und die Übungsanweisungen für jeden Termin. Details zur Kursorganisation findet ihr auf ILIAS.
1.1 PC-Setup
In diesem Kurs werden wir regelmäßig mit R und RStudio arbeiten. Ihr könnt entweder eure eigenen Laptops verwenden oder die Computer im PC-Pool nutzen.
1.1.1 Wenn ihr eure eigenen Laptops verwendet
Bitte installiert vor der ersten R-Übung die aktuellen Versionen von:
1.1.2 Wenn ihr die Computer im PC-Pool verwendet
Wenn ihr an den Computern im PC-Pool arbeitet, müsst ihr zu Beginn jeder Sitzung einige Einstellungen in R vornehmen. Wir werden verschiedene R-Pakete (“libraries”) installieren müssen. Standardmäßig versucht R, ein Paket in eurem Netzwerkverzeichnis (H:) zu installieren, wofür ihr aber keine Berechtigung habt. Wir werden die Pakete daher lokal auf dem Computer installieren – das bedeutet, dass ihr immer den gleichen Computer benutzen oder die Pakete jedes Mal neu installieren müsst.
Legt ein Verzeichnis Rlibraries auf dem Laufwerk D: an.
Führt den folgenden Code vor jeder Sitzung aus (fügt ihn am Anfang eurer Skripte ein). Damit wird R mitgeteilt, wo Pakete installiert und geladen werden sollen.
Sys.setenv(https_proxy = "http://www-proxy1.uni-marburg.de:3128")
Sys.setenv(http_proxy = "http://www-proxy1.uni-marburg.de:3128")
local_user_lib <- paste(Sys.getenv("LOCALAPPDATA"), "\\R_LIBS_TEMP", sep="")
if (! dir.exists(local_user_lib)) { dir.create(local_user_lib) }
.libPaths(c(local_user_lib, .libPaths()[2]))
Sys.setenv(R_LIBS_USER = local_user_lib)1.2 Vorläufiger Zeitplan
Einen vorläufigen Zeitplan für Vorlesung und Übung findet ihr ebenfalls auf ILIAS.